“이 양반은 대역 죄인이니 너무 잘해줄 생각들 말어”
 순조 1년, 신유박해로 세상의 끝 흑산도로 유배된 ‘정약전’.
 호기심 많은 '정약전'은 그 곳에서 바다 생물에 매료되어 책을 쓰기로 한다.
 이에 바다를 훤히 알고 있는 청년 어부 ‘창대’에게 도움을 구하지만
 ‘창대’는 죄인을 도울 수 없다며 단칼에 거절한다.
 
 “내가 아는 지식과 너의 물고기 지식을 바꾸자"
 ‘창대’가 혼자 글 공부를 하며 어려움을 겪고 있다는 것을 알게 된 ‘정약전’은
 서로의 지식을 거래하자고 제안하고
 거래라는 말에 ‘창대’는 못 이기는 척 받아들인다.
 둘은 티격태격하면서도 점차 서로의 스승이자 벗이 되어 간다.
 
 "너 공부해서 출세하고 싶지?"
 그러던 중 '창대'가 출세하기 위해 공부에 매진했다는 사실을 알게 된 '정약전'은 크게 실망한다.
 ‘창대’ 역시 '정약전'과는 길이 다르다는 것을 깨닫고
 '정약전'의 곁을 떠나 세상 밖으로 나가고자 결심하는데...